Руководство введением «Временного положения об управлении в степных областях» 1868 года в Тургайской и Уральской областях было поручено Оренбургскому генерал-губернатору, генерал-адъютанту Н. А. Крыжановскому. Основной задачей администрации стало укрепление авторитета новых должностей и устранение прежней власти султанов-правителей. Крыжановский подчеркивал, что оставление султанов во главе уездов означало бы сохранение старой системы управления «в другом виде».
Однако процесс реформирования встретил сопротивление со стороны казахской родовой знати. Комиссия Ф. К. Гирса, проводившая инспекционные поездки, фиксировала недоверие к реформе и распространение слухов о податях, рекрутчине и насильственном крещении. По наблюдениям современника событий Н. А. Середы, султаны и муллы, приезжавшие в Оренбург под предлогом дел, «увозили в степь лишь те слухи, которые могли предубедить народ против нового порядка вещей». Опасения элиты были связаны с угрозой утраты социального статуса, земельных прав и традиционной системы самоуправления.
Осознавая возможные последствия, Крыжановский выступал за осторожное обращение с бывшими султанами и предложил сохранить за ними материальные льготы. По его инициативе правительство назначило пенсии и награды наиболее влиятельным представителям знати — М. Баймухамедову, М. Джантюрину и Т. Сейдалину. Эти меры должны были предотвратить скрытое сопротивление и смягчить переход к новой системе.
Тем не менее, введение Положения спровоцировало антиколониальное восстание 1868–1869 годов. Главные причины, по мнению Н. Середы и А. Добросмыслова, заключались в «канцелярской тайне» и поспешности: реформы проводились без разъяснений населению, а местная администрация не вела подготовительной работы. К марту 1869 года восстание охватило значительную часть Тургайской и Уральской областей, особенно районы по рекам Илек, Хобда, Уил, Сагиз и Эмба. Для подавления движения по распоряжению военного министра Д. А. Милютина были направлены три карательных отряда под командованием Н. Веревкина численностью свыше 10 тыс. человек. Летом 1869 года повстанцы были окружены, многие аулы откочевали вглубь степи.
После подавления восстания учреждён специальный комитет под председательством Крыжановского, который занимался расследованием и наказанием участников. Административное управление областями окончательно оформилось: во главе стояли военные губернаторы, подчинённые Оренбургскому генерал-губернатору. Первым военным губернатором Тургайской области стал генерал-майор Л. Ф. Баллюзек (1869–1877).
2 января 1869 года состоялось торжественное открытие Тургайского областного правления, пришедшего на смену Областному правлению Оренбургских казахов. На церемонии Крыжановский зачитал слова императора Александра II: «Новое Положение, с Божией помощью, доставит киргизам счастье и будет для них полезно». Завершая обращение, он отметил: «Счастие киргиз есть счастие и благосостояние общего нашего отечества».
Несмотря на оптимистические декларации, реформы 1868 года выявили противоречие между модернизационными целями и колониальной практикой. Введение Положения укрепило имперский контроль над степью, но вызвало массовое недовольство, показав ограниченность колониальной политики, стремившейся к централизации без учёта интересов местного населения.